パッケージ: fastani (1.33-3 など)

[ ソース: fastani  ]

Fast alignment-free computation of whole-genome Average Nucleotide Identity

ANI is defined as mean nucleotide identity of orthologous gene pairs shared between two microbial genomes. FastANI supports pairwise comparison of both complete and draft genome assemblies.

その他の fastani 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, sh4 以外]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [ia64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg) [ia64 以外]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.8) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [alpha, ia64, m68k, sh4]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [alpha, ia64, m68k, sh4 以外]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4 以外]

  圧縮ライブラリ - ランタイム

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

• rec: r-cran-genoplotr

  Plot Publication-Grade Gene and Genome Maps

fastani のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.33-3+b1	98.2 kB	348.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.33-3+b1	110.3 kB	295.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.33-3+b1	94.4 kB	283.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.33-3+b1	88.5 kB	242.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.33-3+b1	90.3 kB	178.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.33-3+b1	104.0 kB	260.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.33-3+b1	117.0 kB	306.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.33-3	135.9 kB	551.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.33-3+b1	98.2 kB	266.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.33-3+b1	103.1 kB	356.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.33-3+b1	109.0 kB	347.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.33-3+b1	111.8 kB	347.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.33-3+b2	104.5 kB	207.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.33-3+b1	109.6 kB	303.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.33-3+b1	122.3 kB	283.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.33-3+b1	88.2 kB	1,054.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.33-3+b1	109.5 kB	270.0 kB	[ファイル一覧]