パッケージ: python3-pyspoa (0.2.1-2 など)

[ ソース: python-pyspoa  ]

Python bindings to spoa

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

This package presents Python bindings for the spoa library

その他の python3-pyspoa 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.32) [alpha, ia64, loong64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.32) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [ia64]

  SIMD partial order alignment library

  dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4) [ia64 以外]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [ia64, m68k 以外]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.14) [ia64 以外]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.13~) [ia64 以外]

python3-pyspoa のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	0.2.1-2+b1	59.9 kB	218.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	0.2.1-2+b1	63.8 kB	180.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.2.1-2+b1	57.1 kB	216.0 kB	[ファイル一覧]
armel	0.2.1-2+b1	55.7 kB	215.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.2.1-2+b1	56.9 kB	151.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	0.2.1-2+b1	62.7 kB	187.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.2.1-2+b1	68.0 kB	175.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	0.0.10-1+b1	90.3 kB	498.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	0.2.1-2+b1	59.2 kB	216.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	0.2.1-2+b1	58.9 kB	159.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	0.2.1-2+b1	58.8 kB	223.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0.2.1-2+b1	63.8 kB	216.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.2.1-2+b1	64.6 kB	216.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.2.1-2+b1	61.3 kB	140.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.2.1-2+b1	62.9 kB	180.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	0.2.1-2+b1	75.8 kB	216.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	0.2.1-2+b1	53.1 kB	1,053.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0.2.1-2+b1	63.8 kB	167.0 kB	[ファイル一覧]