[ ソース: python-pyspoa ]
パッケージ: python3-pyspoa (0.0.8-3 など)
python3-pyspoa に関するリンク
Debian の資源:
python-pyspoa ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [github.com]
類似のパッケージ:
Python bindings to spoa
Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).
This package presents Python bindings for the spoa library
その他の python3-pyspoa 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.32)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5) [amd64]
- SIMD partial order alignment library
- dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [amd64 以外]
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: python3 (<< 3.12)
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (>= 3.11~)
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- dep: python3-pybind11
- pybind11 helper module for Python 3
python3-pyspoa のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 0.0.8-3+b2 | 49.9 kB | 143.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 0.0.8-3+b2 | 45.1 kB | 151.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 0.0.8-3+b2 | 42.9 kB | 126.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 0.0.8-3+b2 | 42.8 kB | 98.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 0.0.8-3+b2 | 54.1 kB | 146.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 0.0.8-3+b2 | 48.1 kB | 220.0 kB | [ファイル一覧] |
| mipsel | 0.0.8-3+b2 | 47.6 kB | 154.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 0.0.8-3+b2 | 53.2 kB | 215.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 0.0.8-3+b2 | 47.0 kB | 151.0 kB | [ファイル一覧] |