Paquet : python3-pyspoa (0.2.1-2 et autres)

[ Paquet source : python-pyspoa  ]

Python bindings to spoa

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

This package presents Python bindings for the spoa library

Autres paquets associés à python3-pyspoa

• dep: libc6 (>= 2.32) [non alpha, ia64, loong64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.32) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [ia64]

  SIMD partial order alignment library

  dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4) [non ia64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [non ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.14) [non ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.13~) [non ia64]

Télécharger python3-pyspoa

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	0.2.1-2+b1	59,9 ko	218,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	0.2.1-2+b1	63,8 ko	180,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.2.1-2+b1	57,1 ko	216,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.2.1-2+b1	55,7 ko	215,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.2.1-2+b1	56,9 ko	151,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	0.2.1-2+b1	62,7 ko	187,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.2.1-2+b1	68,0 ko	175,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	0.0.10-1+b1	90,3 ko	498,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	0.2.1-2+b1	59,2 ko	216,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	0.2.1-2+b1	58,9 ko	159,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.2.1-2+b1	58,8 ko	223,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	0.2.1-2+b1	63,8 ko	216,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.2.1-2+b1	64,6 ko	216,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.2.1-2+b1	61,3 ko	140,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.2.1-2+b1	62,9 ko	180,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	0.2.1-2+b1	75,8 ko	216,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	0.2.1-2+b1	53,1 ko	1 053,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	0.2.1-2+b1	63,8 ko	167,0 ko	[liste des fichiers]