パッケージ: pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3 など)

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メンテナ:

外部の資源:

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類似のパッケージ:

simulator for PacBio sequencing reads

PacBio DNA sequencers produce two types of characteristic reads: CCS (short and low error rate) and CLR (long and high error rate), both of which could be useful for de novo assembly of genomes. PBSIM simulates those PacBio reads from a reference sequence by using either a model-based or sampling-based simulation. Simulated reads are useful, for example, when developing or evaluating sequence assemblers targeted at PacBio data.

タグ: 生物学: 核酸, 分野: 生物学, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, 役割: プログラム, 目的: use::simulating, works-with::biological-sequence

その他の pbsim 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, arm64, ia64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sparc64]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [sparc64]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

pbsim のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	26.0 kB	121.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24.9 kB	100.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3+b1	24.5 kB	121.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24.5 kB	91.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	23.9 kB	83.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	26.3 kB	92.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25.8 kB	99.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-2	31.1 kB	128.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25.3 kB	103.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25.4 kB	122.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	26.7 kB	120.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	27.1 kB	120.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3+b1	25.0 kB	89.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	23.6 kB	92.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	29.4 kB	119.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24.2 kB	1,081.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24.8 kB	91.0 kB	[ファイル一覧]