Пакет: pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3 и другие)

Ссылки для pbsim

Ресурсы Debian:

Исходный код pbsim:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

simulator for PacBio sequencing reads

PacBio DNA sequencers produce two types of characteristic reads: CCS (short and low error rate) and CLR (long and high error rate), both of which could be useful for de novo assembly of genomes. PBSIM simulates those PacBio reads from a reference sequence by using either a model-based or sampling-based simulation. Simulated reads are useful, for example, when developing or evaluating sequence assemblers targeted at PacBio data.

Теги: Биология: Нуклеиновые кислоты, Область: Биология, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Роль: Программа, Цель: use::simulating, works-with::biological-sequence

Другие пакеты, относящиеся к pbsim

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, arm64, ia64, sh4]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [sparc64]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [sparc64]

стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка pbsim

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	26,0 Кб	121,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,9 Кб	100,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3+b1	24,5 Кб	121,0 Кб	[список файлов]
armel	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,5 Кб	91,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	23,9 Кб	83,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	26,3 Кб	92,0 Кб	[список файлов]
i386	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25,8 Кб	99,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-2	31,1 Кб	128,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25,3 Кб	103,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	25,4 Кб	122,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	26,7 Кб	120,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	27,1 Кб	120,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3+b1	25,0 Кб	89,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	23,6 Кб	92,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	29,4 Кб	119,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,2 Кб	1 081,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3	24,8 Кб	91,0 Кб	[список файлов]