パッケージ: pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-2)

pbsim に関するリンク

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

simulator for PacBio sequencing reads

PacBio DNA sequencers produce two types of characteristic reads: CCS (short and low error rate) and CLR (long and high error rate), both of which could be useful for de novo assembly of genomes. PBSIM simulates those PacBio reads from a reference sequence by using either a model-based or sampling-based simulation. Simulated reads are useful, for example, when developing or evaluating sequence assemblers targeted at PacBio data.

タグ: 生物学: 核酸, 分野: 生物学, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, 役割: プログラム, 目的: use::simulating, works-with::biological-sequence

その他の pbsim 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

pbsim のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	25.0 kB	97.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	24.2 kB	93.0 kB	[ファイル一覧]
armel	24.6 kB	92.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	24.1 kB	84.0 kB	[ファイル一覧]
i386	26.0 kB	100.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	25.5 kB	99.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	26.0 kB	98.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	26.7 kB	121.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	23.7 kB	93.0 kB	[ファイル一覧]