パッケージ: autodock-vina (1.2.7-1 など)

[ ソース: autodock-vina  ]

docking of small molecules to proteins

AutoDock Vina is a program to support drug discovery, molecular docking and virtual screening of compound libraries. It offers multi-core capability, high performance and enhanced accuracy and ease of use.

The same institute also developed autodock, which is widely used.

O. Trott, A. J. Olson, AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading, Journal of Computational Chemistry 31 (2010) 455-461

その他の autodock-vina 関連パッケージ

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  C++ 用プログラムオプションライブラリ

• dep: libboost-thread1.83.0 (>= 1.83.0)

  portable C++ multi-threading

• dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, loong64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.41) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [ia64, m68k 以外]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• sug: autodock

  タンパク質構造に結合するリガンドの分析ツール

• sug: autogrid

  リガンドの受容体への結合を事前計算

autodock-vina のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.2.7-1	241.6 kB	791.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.2.7-1	266.4 kB	700.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.2.7-1	237.1 kB	660.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.2.7-1	244.6 kB	722.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.2.7-1	235.5 kB	530.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.2.7-1	250.0 kB	646.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.2.7-1	277.2 kB	722.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.2.5-2	290.5 kB	1,237.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	1.2.7-1	252.1 kB	660.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.2.7-1	246.5 kB	682.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.2.7-1	236.5 kB	817.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.2.7-1	265.4 kB	916.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.2.7-1	268.7 kB	852.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.2.7-1	259.7 kB	572.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.2.7-1	261.1 kB	696.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.2.7-1	300.0 kB	723.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.2.7-1	221.5 kB	2,140.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.2.7-1	268.0 kB	654.0 kB	[ファイル一覧]