Paketti: autodock-vina (1.2.7-1 ja muut)

[ Source: autodock-vina  ]

docking of small molecules to proteins

AutoDock Vina is a program to support drug discovery, molecular docking and virtual screening of compound libraries. It offers multi-core capability, high performance and enhanced accuracy and ease of use.

The same institute also developed autodock, which is widely used.

O. Trott, A. J. Olson, AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading, Journal of Computational Chemistry 31 (2010) 455-461

Muut pakettiin autodock-vina liittyvät paketit

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libboost-thread1.83.0 (>= 1.83.0)

  portable C++ multi-threading

• dep: libc6 (>= 2.38) [ei alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.41) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [ei ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: autodock

  analysis of ligand binding to protein structure

• sug: autogrid

  pre-calculate binding of ligands to their receptor

Imuroi autodock-vina

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.2.7-1	241.6 kt	791.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.2.7-1	266.4 kt	700.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.2.7-1	237.1 kt	660.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.2.7-1	244.6 kt	722.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.2.7-1	235.5 kt	530.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.2.7-1	250.0 kt	646.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.2.7-1	277.2 kt	722.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.2.5-2	290.5 kt	1,237.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	1.2.7-1	252.1 kt	660.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.2.7-1	246.5 kt	682.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.2.7-1	236.5 kt	817.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.2.7-1	265.4 kt	916.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.2.7-1	268.7 kt	852.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.2.7-1	259.7 kt	572.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.2.7-1	261.1 kt	696.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.2.7-1	300.0 kt	723.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.2.7-1	221.5 kt	2,140.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.2.7-1	268.0 kt	654.0 kt	[tiedostoluettelo]