Paketti: autodock-vina (1.2.5-2 ja muut)

[ Source: autodock-vina  ]

docking of small molecules to proteins

AutoDock Vina is a program to support drug discovery, molecular docking and virtual screening of compound libraries. It offers multi-core capability, high performance and enhanced accuracy and ease of use.

The same institute also developed autodock, which is widely used.

O. Trott, A. J. Olson, AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading, Journal of Computational Chemistry 31 (2010) 455-461

Muut pakettiin autodock-vina liittyvät paketit

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  program options library for C++

• dep: libboost-system1.83.0 (>= 1.83.0) [sparc64]

  Operating system (e.g. diagnostics support) library

• dep: libboost-thread1.83.0 (>= 1.83.0)

  portable C++ multi-threading

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, arm64, ia64, sh4, x32]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei arm64, x32]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: autodock

  analysis of ligand binding to protein structure

• sug: autogrid

  pre-calculate binding of ligands to their receptor

Imuroi autodock-vina

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.2.5-2+b1	237.5 kt	728.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.2.5-2	261.0 kt	672.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.2.5-2+b1	235.7 kt	661.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.2.5-2	239.1 kt	638.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.2.5-2	231.5 kt	474.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.2.5-2	247.2 kt	638.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.2.5-2	270.3 kt	698.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.2.5-2	290.5 kt	1,237.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.2.5-2	232.1 kt	666.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.2.5-2	231.3 kt	753.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.2.5-2	262.2 kt	916.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.2.5-2	265.9 kt	852.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.2.5-2	257.0 kt	576.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.2.5-2	255.1 kt	680.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.2.5-2	265.7 kt	659.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.2.5-2	217.1 kt	2,140.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.2.5-2+b1	259.9 kt	639.0 kt	[tiedostoluettelo]