パッケージ: autodock-vina (1.1.2-6 など)

[ ソース: autodock-vina  ]

docking of small molecules to proteins

AutoDock Vina is a program to support drug discovery, molecular docking and virtual screening of compound libraries. It offers multi-core capability, high performance and enhanced accuracy and ease of use.

The same institute also developed autodock, which is widely used.

O. Trott, A. J. Olson, AutoDock Vina: improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization and multithreading, Journal of Computational Chemistry 31 (2010) 455-461

その他の autodock-vina 関連パッケージ

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  C++ 用プログラムオプションライブラリ

• dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0)

  portable C++ multi-threading

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [armel, armhf 以外]

• sug: autodock

  タンパク質構造に結合するリガンドの分析ツール

• sug: autogrid

  リガンドの受容体への結合を事前計算

autodock-vina のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1.1.2-6+b1	233.0 kB	598.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.1.2-6+b1	208.8 kB	542.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.1.2-6+b1	209.3 kB	536.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.1.2-6+b1	204.0 kB	408.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.1.2-6+b1	236.9 kB	596.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.1.2-6+b1	210.4 kB	657.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	1.1.2-6+b1	213.7 kB	641.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.1.2-6+b1	234.0 kB	726.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.1.2-6+b1	207.3 kB	578.0 kB	[ファイル一覧]