パッケージ: libssw0 (1.1-13)

[ ソース: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

タグ: 役割: 共有ライブラリ

その他の libssw0 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [amd64, arm64, ppc64el 以外]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: zlib1g

  圧縮ライブラリ - ランタイム

libssw0 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	19.2 kB	55.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	18.1 kB	51.0 kB	[ファイル一覧]
armel	20.5 kB	59.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	20.7 kB	51.0 kB	[ファイル一覧]
i386	26.5 kB	83.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	26.1 kB	77.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	25.7 kB	72.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	19.4 kB	83.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	23.2 kB	71.0 kB	[ファイル一覧]