Paquet : libssw0 (1.1-13)

[ Paquet source : libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Étiquettes: Rôle: Bibliothèque partagée

Autres paquets associés à libssw0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [non amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger libssw0

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	19,2 ko	55,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	18,1 ko	51,0 ko	[liste des fichiers]
armel	20,5 ko	59,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	20,7 ko	51,0 ko	[liste des fichiers]
i386	26,5 ko	83,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	26,1 ko	77,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	25,7 ko	72,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	19,4 ko	83,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	23,2 ko	71,0 ko	[liste des fichiers]