Paket: libssw0 (1.1-13)

[ Quellcode: libssw  ]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Markierungen: Rolle: Laufzeit-Bibliothek

Andere Pakete mit Bezug zu libssw0

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nicht amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

libssw0 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	19,2 kB	55,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	18,1 kB	51,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	20,5 kB	59,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	20,7 kB	51,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	26,5 kB	83,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	26,1 kB	77,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	25,7 kB	72,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	19,4 kB	83,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	23,2 kB	71,0 kB	[Liste der Dateien]