Paketti: freebayes (1.3.6-2)

[ Source: freebayes  ]

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Muut pakettiin freebayes liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

  dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [ei amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg)

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

Imuroi freebayes

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1,441.5 kt	3,976.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1,391.0 kt	3,903.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1,377.0 kt	3,903.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1,384.4 kt	3,455.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1,502.8 kt	4,171.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1,435.5 kt	4,360.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	1,453.7 kt	4,345.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1,461.7 kt	4,288.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1,383.8 kt	4,050.0 kt	[tiedostoluettelo]