Package: seqtk (1.4-2 and others)

[ Source: seqtk  ]

Hurtigt letvægtsværktøj til behandling af sekvenser i formaterne FASTA eller FASTQ

I øjeblikket understøtter seqtk en kvalitetsbaseret justering med algoritmen phred, konvertering fra fastq til fasta, komplementering af omvendte sekvenser, udpakning eller maskering af delsekvender i regioner, der stammer fra en BED/navneliste-fil, og mere. Den indeholder et modul til at indsamle delvise prøver, der indsamler eksakt n sekvenser eller en fraktion af sekvenser.

Seqtk understøtter både inddatafiler af typen fasta og fastq, der valgfrit kan komprimeres med gzip.

Other Packages Related to seqtk

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download seqtk

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.4-2	33.8 kB	95.0 kB	[list of files]
arm64	1.4-2+b1	32.2 kB	88.0 kB	[list of files]
armel	1.4-2	32.3 kB	91.0 kB	[list of files]
armhf	1.4-2	32.0 kB	71.0 kB	[list of files]
i386	1.4-2	37.3 kB	103.0 kB	[list of files]
mips64el	1.4-2	32.1 kB	154.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.4-2	37.2 kB	151.0 kB	[list of files]
riscv64	1.4-2+b1	34.7 kB	80.0 kB	[list of files]
s390x	1.4-2	33.9 kB	95.0 kB	[list of files]