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[ Source: libgkarrays  ]

Package: libgkarrays-dev (2.1.0+dfsg-4.2 and others)

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libreria per interrogare grandi collezioni di sequenze NGS (sviluppo)

Gli Gk-array vengono forniti come libreria C++ facile da usare dedicata alle interrogazioni di grandi collezioni di sequenze, come quelle prodotte da sequenziatori ad alte prestazioni (es. HiSeq 2000 da Illumina, 454 da Roche).

Gli Gk-array indicizzano i k-meri delle letture e permettono di rispondere a diverse interrogazioni su quella collezione di letture (es. quante letture condividono questo k-mero? dove è presente questo k-mero nella collezione di letture?).

Gli Gk-array rappresentano un'alternativa efficiente alle tabelle hash in termini di spazio, pur essendo simili in termini di tempi di interrogazione.

Questa è la libreria di sviluppo per libgkarrays.

Tags: Software Development: Libraries, Role: Development Library

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Architecture Version Package Size Installed Size Files
amd64 2.1.0+dfsg-4.2 83.2 kB515.0 kB [list of files]
arm64 2.1.0+dfsg-4.2+b1 81.3 kB513.0 kB [list of files]
armel 2.1.0+dfsg-4.2 81.2 kB461.0 kB [list of files]
armhf 2.1.0+dfsg-4.2 80.0 kB439.0 kB [list of files]
i386 2.1.0+dfsg-4.2 90.7 kB495.0 kB [list of files]
mips64el 2.1.0+dfsg-4.2 89.6 kB563.0 kB [list of files]
ppc64el 2.1.0+dfsg-4.2 87.1 kB531.0 kB [list of files]
riscv64 2.1.0+dfsg-4.2 160.8 kB1,390.0 kB [list of files]
s390x 2.1.0+dfsg-4.2 79.4 kB510.0 kB [list of files]