Paquet : libgkarrays-dev (2.1.0+dfsg-4.2 et autres)

[ Paquet source : libgkarrays  ]

library to query large collection of NGS sequences (development)

Gk-arrays are provided as a simple-to-use C++ library dedicated to queries on large collection of sequences as produced by high-throughput sequencers (e.g. HiSeq 2000 from Illumina, 454 from Roche).

Gk-arrays index k-mers of reads and allows one to answer different queries on that read collection (e.g. how many reads share this k-mer? where does this k-mer occur in the read collection?).

Gk-arrays consist of a space-efficient alternative to hash tables while being similar in terms of query times.

This is the development library for libgkarrays.

Étiquettes: Développement de logiciel: Bibliothèques, Rôle: Bibliothèque de programmation

Autres paquets associés à libgkarrays-dev

• dep: libgkarrays1t64 (= 2.1.0+dfsg-4.2) [non arm64]

  library to query large collection of NGS sequences

  dep: libgkarrays1t64 (= 2.1.0+dfsg-4.2+b1) [arm64]

Télécharger libgkarrays-dev

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	2.1.0+dfsg-4.2	83,2 ko	515,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.1.0+dfsg-4.2+b1	81,3 ko	513,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.1.0+dfsg-4.2	81,2 ko	461,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.1.0+dfsg-4.2	80,0 ko	439,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.1.0+dfsg-4.2	90,7 ko	495,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.1.0+dfsg-4.2	89,6 ko	563,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.1.0+dfsg-4.2	87,1 ko	531,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.1.0+dfsg-4.2	160,8 ko	1 390,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.1.0+dfsg-4.2	79,4 ko	510,0 ko	[liste des fichiers]