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Package: libgkarrays1t64 (2.1.0+dfsg-4.2 and others)

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libreria per interrogare grandi collezioni di sequenze NGS

Gli Gk-array vengono forniti come libreria C++ facile da usare dedicata alle interrogazioni di grandi collezioni di sequenze, come quelle prodotte da sequenziatori ad alte prestazioni (es. HiSeq 2000 da Illumina, 454 da Roche).

Gli Gk-array indicizzano i k-meri delle letture e permettono di rispondere a diverse interrogazioni su quella collezione di letture (es. quante letture condividono questo k-mero? dove รจ presente questo k-mero nella collezione di letture?).

Gli Gk-array rappresentano un'alternativa efficiente alle tabelle hash in termini di spazio, pur essendo simili in termini di tempi di interrogazione.

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Architecture Version Package Size Installed Size Files
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armhf 2.1.0+dfsg-4.2 51.6 kB133.0 kB [list of files]
i386 2.1.0+dfsg-4.2 62.7 kB185.0 kB [list of files]
mips64el 2.1.0+dfsg-4.2 55.0 kB255.0 kB [list of files]
ppc64el 2.1.0+dfsg-4.2 58.1 kB246.0 kB [list of files]
riscv64 2.1.0+dfsg-4.2 57.7 kB149.0 kB [list of files]
s390x 2.1.0+dfsg-4.2 52.5 kB173.0 kB [list of files]