Package: gbrowse (2.56+dfsg-12)

[ Source: gbrowse  ]

browser generico per genoma di GMOD

Generic Genome Browser è un browser per genoma, basato sul web, semplice ma altamente configurabile. È un componente del progetto GMOD (Generic Model Organism Systems Database). Alcune delle sue caratteristiche sono:

 * viste simultanee a volo d'uccello e dettagliata del genoma;
 * scorrimento, ingrandimento e centratura;
 * inclusione di URL arbitrari a qualsiasi annotazione;
 * l'ordine e l'aspetto delle tracce sono personalizzabili
   dall'amministratore e dall'utente finale;
 * ricerca in base a ID, nome o commenti;
 * gestione di annotazioni di terze parti usando i formati GFF;
 * impostazioni persistenti tra le sessioni;
 * dump di DNA e GFF;
 * connettività con database diversi, inclusi BioSQL e Chado;
 * supporto per più lingue;
 * caricamento di funzionalità di terze parti;
 * architettura a plugin personalizzabile (ad esempio, esecuzione di
   BLAST, dump & importazione di molti formati, ricerca di
   oligonucleotidi, progettazione di primer, creazione di mappe di
   restrizione, modifica delle caratteristiche).

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::perl, interface::web, Role: Program, Purpose: Analysing, use::viewing, web::application, World Wide Web: CGI

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