Package: kissplice (2.1.0-1) [debports]

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rilevamento di vari tipi di polimorfismi in dati RNA-Seq

KisSplice è un software che permette l'analisi di dati RNA-Seq con o senza un genoma di riferimento. È un assemblatore esatto di trascrittoma che permette di identificare SNP, indel e eventi di splicing alternativo. Può lavorare con un numero arbitrario di condizioni biologiche e quantifica ciascuna variante in ogni condizione. È stato provato su insiemi di dati Illumina con fino a 1G di letture. Il suo consumo di memoria è di circa 5Gb per 100M letture.

Other Packages Related to kissplice

• dep: libc6 (>= 2.17)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:4.2.1)

  Package not available

• dep: libstdc++6 (>= 4.6)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: python

  Package not available

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
sh4 (unofficial port)	1,282.1 kB	2,090.0 kB	[list of files]