Package: plink2 (2.00~a5.8-231123+dfsg-1 and others)

[ Source: plink2  ]

insieme di strumenti di analisi per associazione dell'intero genoma

plink si aspetta in input i dati da chip SNP (polimorfismi a singolo nucleotide) di molti individui e la loro descrizione fenotipica di una malattia. Trova associazioni tra una variazione singola o una coppia di variazioni nel DNA con un fenotipo e può recuperare le annotazioni SNP da una fonte in linea.

Gli SNP possono essere analizzati individualmente o a coppie per valutare la loro associazione con fenotipi di malattie. È possibile ricercare congiuntamente variazioni nel numero di copie. Sono stati implementati svariati test statistici.

plink2 è un aggiornamento esaustivo di plink e plink1.9 con nuovi algoritmi e nuovi metodi, più veloce e con meno consumo di memoria rispetto al primo plink.

Other Packages Related to plink2

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k]

  libreria ausiliaria che fornisce funzioni __atomic incorporate

• dep: libblas3

  implementazione di riferimento dell'algebra lineare di base, libreria condivisa

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  compressione e decompressione veloci di buffer interi basate su DEFLATE

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64, sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

• dep: liblapack3

  libreria di routine per l'algebra lineare 3 - versione condivisa

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [armel, armhf, sparc64]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: libzstd1 (>= 1.5.5)

  veloce algoritmo di compressione senza perdita

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

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Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	1,202.6 kB	3,349.0 kB	[list of files]
amd64	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	2,498.0 kB	17,091.0 kB	[list of files]
arm64	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	1,001.5 kB	2,644.0 kB	[list of files]
armel	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	951.1 kB	2,670.0 kB	[list of files]
armhf	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	953.9 kB	1,934.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	1,080.5 kB	2,845.0 kB	[list of files]
i386	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	1,634.5 kB	12,487.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1	1,504.3 kB	5,769.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	976.6 kB	2,723.0 kB	[list of files]
mips64el	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	1,191.3 kB	3,577.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	1,207.3 kB	3,605.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	1,150.3 kB	3,220.0 kB	[list of files]
riscv64	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b2	1,261.2 kB	2,580.0 kB	[list of files]
s390x	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	1,254.9 kB	3,396.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	1,102.3 kB	4,185.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	1,071.4 kB	2,750.0 kB	[list of files]