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Package: plink2 (2.00~a3.5-220809+dfsg-2~0exp0simde) [debports]

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insieme di strumenti di analisi per associazione dell'intero genoma

plink si aspetta in input i dati da chip SNP (polimorfismi a singolo nucleotide) di molti individui e la loro descrizione fenotipica di una malattia. Trova associazioni tra una variazione singola o una coppia di variazioni nel DNA con un fenotipo e può recuperare le annotazioni SNP da una fonte in linea.

Gli SNP possono essere analizzati individualmente o a coppie per valutare la loro associazione con fenotipi di malattie. È possibile ricercare congiuntamente variazioni nel numero di copie. Sono stati implementati svariati test statistici.

plink2 è un aggiornamento esaustivo di plink e plink1.9 con nuovi algoritmi e nuovi metodi, più veloce e con meno consumo di memoria rispetto al primo plink.

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