Package: plink2 (2.00~a3-210203+dfsg-1 and others)

[ Source: plink2  ]

insieme di strumenti di analisi per associazione dell'intero genoma

plink si aspetta in input i dati da chip SNP (polimorfismi a singolo nucleotide) di molti individui e la loro descrizione fenotipica di una malattia. Trova associazioni tra una variazione singola o una coppia di variazioni nel DNA con un fenotipo e può recuperare le annotazioni SNP da una fonte in linea.

Gli SNP possono essere analizzati individualmente o a coppie per valutare la loro associazione con fenotipi di malattie. È possibile ricercare congiuntamente variazioni nel numero di copie. Sono stati implementati svariati test statistici.

plink2 è un aggiornamento esaustivo di plink e plink1.9 con nuovi algoritmi e nuovi metodi, più veloce e con meno consumo di memoria rispetto al primo plink.

Other Packages Related to plink2

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, mipsel]

  libreria ausiliaria che fornisce funzioni __atomic incorporate

• dep: libblas3

  implementazione di riferimento dell'algebra lineare di base, libreria condivisa

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  compressione e decompressione veloci di buffer interi basate su DEFLATE

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: liblapack3

  libreria di routine per l'algebra lineare 3 - versione condivisa

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [armel, armhf]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: libzstd1 (>= 1.4.0)

  veloce algoritmo di compressione senza perdita

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

Download plink2

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	1,796.9 kB	14,206.0 kB	[list of files]
arm64	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	828.6 kB	2,183.0 kB	[list of files]
armel	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	793.7 kB	2,249.0 kB	[list of files]
armhf	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	805.3 kB	1,645.0 kB	[list of files]
i386	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	1,210.7 kB	10,374.0 kB	[list of files]
mips64el	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	977.4 kB	2,955.0 kB	[list of files]
mipsel	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	900.0 kB	2,683.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	960.9 kB	2,831.0 kB	[list of files]
s390x	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	899.6 kB	2,687.0 kB	[list of files]