Package: infernal (1.1.5-3 and others)

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inferenza degli allineamenti strutturali secondari dell'RNA

Infernal ("INFERence of RNA ALignment", "inferenza per l'allineamento dell'RNA") cerca in un database di sequenze DNA somiglianze tra strutture e sequenze di RNA. Fornisce un'implementazione di un caso speciale delle grammatiche senza contesto con profilo stocastico chiamate modelli covarianti (CM). Un CM è come un profilo di sequenza, ma dà una valutazione combinando il consenso della sequenza e il consenso sulla struttura secondaria dell'RNA, così in molti casi è più efficace nell'identificare omologhi RNA che conservano la loro struttura secondaria più che la loro sequenza primaria.

Questo strumento è una parte integrante del database Rfam.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
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arm64	1.1.5-3	5,430.6 kB	49,685.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.0.2-1	4,144.2 kB	8,324.0 kB	[list of files]
i386	1.1.5-3	5,782.1 kB	56,827.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.0.2-2	3,371.3 kB	7,800.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.0.2-2	4,909.3 kB	11,058.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.0.2-2	4,311.1 kB	7,876.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.0.2-2	4,465.1 kB	9,210.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.1.5-3	5,782.7 kB	51,130.0 kB	[list of files]