パッケージ: infernal (1.1.5-3 など)

[ ソース: infernal  ]

inference of RNA secondary structural alignments

Infernal ("INFERence of RNA ALignment") searches DNA sequence databases for RNA structure and sequence similarities. It provides an implementation of a special variant of profile stochastic context-free grammars called covariance models (CMs). A CM is like a sequence profile, but it scores a combination of sequence consensus and RNA secondary structure consensus, so in many cases, it is more capable of identifying RNA homologs that conserve their secondary structure more than their primary sequence.

The tool is an integral component of the Rfam database.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 目的: 解析

その他の infernal 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.10) [hppa]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.13) [ppc64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.3) [m68k, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, i386, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

infernal のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.0.2-2	5,014.4 kB	10,940.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.1.5-3	5,796.9 kB	52,049.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.1.5-3	5,430.6 kB	49,685.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.0.2-1	4,144.2 kB	8,324.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.1.5-3	5,782.1 kB	56,827.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.0.2-2	3,371.3 kB	7,800.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.0.2-2	4,909.3 kB	11,058.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.0.2-2	4,311.1 kB	7,876.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.0.2-2	4,465.1 kB	9,210.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.1.5-3	5,782.7 kB	51,130.0 kB	[ファイル一覧]