Package: hyphy-mpi (2.5.69+dfsg-1 and others)

[ Source: hyphy  ]

test di ipotesi usando filogenesi (versione MPI)

HyPhy è un pacchetto software open source per l'analisi di sequenze genetiche usando tecniche di filogenetica, evoluzione molecolare e apprendimento macchina. Ha un'interfaccia utente grafica (GUI) completa e un ricco linguaggio per script per una illimitata personalizzazione delle analisi. In aggiunta HyPhy gestisce ambienti di calcolo parallelo (attraverso interfaccia di passaggio di messaggi) e può essere compilato come libreria condivisa e richiamato da altri ambienti di programmazione, come Python o R. Il proseguimento dello sviluppo di HyPhy è attualmente supportato in parte da un premio NIGMS R01 1R01GM093939.

Questo pacchetto fornisce un eseguibile che utilizza MPI per fare la multielaborazione.

Other Packages Related to hyphy-mpi

• dep: hyphy-common (= 2.5.60+dfsg-1) [ia64]

  test di ipotesi usando filogenesi (file comuni)

  dep: hyphy-common (= 2.5.69+dfsg-1) [not ia64]

• dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, loong64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2) [ia64]

  libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione GnuTLS)

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [not ia64]

  libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione GnuTLS)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - libreria condivisa

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.7) [not armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4, x32]

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - libreria condivisa

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  libreria condivisa SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 5) [not ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  libreria di compressione - runtime

Download hyphy-mpi

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.5.69+dfsg-1	835.5 kB	2,852.0 kB	[list of files]
amd64	2.5.69+dfsg-1	1,499.0 kB	7,402.0 kB	[list of files]
arm64	2.5.69+dfsg-1	801.3 kB	2,272.0 kB	[list of files]
armel	2.5.69+dfsg-1	779.6 kB	2,207.0 kB	[list of files]
armhf	2.5.69+dfsg-1	767.8 kB	1,503.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.5.69+dfsg-1	801.8 kB	2,159.0 kB	[list of files]
i386	2.5.69+dfsg-1	1,015.7 kB	2,627.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.5.60+dfsg-1	1,061.2 kB	4,867.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	2.5.69+dfsg-1	885.2 kB	2,400.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.5.69+dfsg-1	756.6 kB	2,359.0 kB	[list of files]
mips64el	2.5.69+dfsg-1	797.4 kB	2,879.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.5.69+dfsg-1	888.6 kB	2,976.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.5.69+dfsg-1	911.8 kB	2,784.0 kB	[list of files]
riscv64	2.5.69+dfsg-1	877.5 kB	1,768.0 kB	[list of files]
s390x	2.5.69+dfsg-1	947.5 kB	2,620.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.5.69+dfsg-1	924.9 kB	2,016.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.5.69+dfsg-1	710.1 kB	3,109.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.5.69+dfsg-1	930.0 kB	2,315.0 kB	[list of files]