Paket: hyphy-mpi (2.5.69+dfsg-1 und andere)

[ Quellcode: hyphy  ]

Hypothesentest unter Verwendung von Phylogenie (MPI-Version)

HyPhy ist ein quelloffenes Softwarepaket für die Analyse genetischer Sequenzen unter Verwendung phylogenetischer Techniken, molekularer Evolution und maschinellem Lernen. Es beinhaltet eine komplette grafische Benutzeroberfläche (GUI) und eine mächtige Skriptsprache für grenzenlose Anpassungsmöglichkeiten der Analysen. Zusätzlich unterstützt HyPhy Umgebungen für parallele Datenverarbeitung (via einer Schnittstelle für den Nachrichtenaustausch) und kann als Laufzeitbibliothek kompiliert und von anderen Programmierumgebungen, wie Python oder R, aufgerufen werden. Die Weiterentwicklung von HyPhy wird momentan teilweise von einem Forschungsprojekt-Zuschuss der NIGMS (1R01GM093939) unterstützt.

Dieses Paket enthält eine ausführbare Datei, die MPI für Simultanverarbeitung verwendet.

Andere Pakete mit Bezug zu hyphy-mpi

• dep: hyphy-common (= 2.5.60+dfsg-1) [ia64]

  Hypothesentest unter Verwendung von Phylogenie (gemeinsame Dateien)

  dep: hyphy-common (= 2.5.69+dfsg-1) [nicht ia64]

• dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2) [ia64]

  Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [nicht ia64]

  Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.7) [nicht armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4, x32]

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Laufzeit-Bibliothek für SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 5) [nicht ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

hyphy-mpi herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	2.5.69+dfsg-1	835,5 kB	2.852,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	2.5.69+dfsg-1	1.499,0 kB	7.402,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.5.69+dfsg-1	801,3 kB	2.272,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	2.5.69+dfsg-1	779,6 kB	2.207,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	2.5.69+dfsg-1	767,8 kB	1.503,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	2.5.69+dfsg-1	801,8 kB	2.159,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.5.69+dfsg-1	1.015,7 kB	2.627,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.5.60+dfsg-1	1.061,2 kB	4.867,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	2.5.69+dfsg-1	885,2 kB	2.400,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	2.5.69+dfsg-1	756,6 kB	2.359,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.5.69+dfsg-1	797,4 kB	2.879,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.5.69+dfsg-1	888,6 kB	2.976,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.5.69+dfsg-1	911,8 kB	2.784,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.5.69+dfsg-1	877,5 kB	1.768,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	2.5.69+dfsg-1	947,5 kB	2.620,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	2.5.69+dfsg-1	924,9 kB	2.016,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	2.5.69+dfsg-1	710,1 kB	3.109,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	2.5.69+dfsg-1	930,0 kB	2.315,0 kB	[Liste der Dateien]