Paquet : hyphy-mpi (2.5.63+dfsg-1 et autres)

[ Paquet source : hyphy  ]

Hypothesis testing using Phylogenies (MPI version)

HyPhy is an open-source software package for the analysis of genetic sequences using techniques in phylogenetics, molecular evolution, and machine learning. It features a complete graphical user interface (GUI) and a rich scripting language for limitless customization of analyses. Additionally, HyPhy features support for parallel computing environments (via message passing interface) and it can be compiled as a shared library and called from other programming environments such as Python or R. Continued development of HyPhy is currently supported in part by an NIGMS R01 award 1R01GM093939.

This package provides an executable using MPI to do multiprocessing.

Autres paquets associés à hyphy-mpi

• dep: hyphy-common (= 2.5.60+dfsg-1) [ia64]

  test statistique en utilisant des phylogénies – fichiers communs

  dep: hyphy-common (= 2.5.63+dfsg-1) [non ia64]

• dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.16.2) [ia64]

  bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [non ia64]

  bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libmpich12 [armel, armhf, hppa, i386, m68k, sh4]

  Shared libraries for MPICH

  dep: libmpich12 (>= 4.2.0) [x32]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [ia64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [non armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, sh4, x32]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Bibliothèque partagée SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 5) [non ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger hyphy-mpi

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.5.63+dfsg-1+b1	835,9 ko	2 853,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.5.63+dfsg-1+b1	1 499,9 ko	7 403,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.5.63+dfsg-1+b1	796,4 ko	2 337,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.5.63+dfsg-1	779,2 ko	2 179,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.5.63+dfsg-1	767,5 ko	1 495,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.5.63+dfsg-1	801,8 ko	2 159,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.5.63+dfsg-1	1 015,8 ko	2 627,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.5.60+dfsg-1	1 061,2 ko	4 867,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.5.63+dfsg-1	756,1 ko	2 351,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.5.63+dfsg-1+b1	798,1 ko	2 880,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.5.63+dfsg-1+b1	888,9 ko	2 977,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.5.63+dfsg-1+b1	912,3 ko	2 785,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.5.63+dfsg-1+b1	877,2 ko	1 765,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.5.63+dfsg-1+b1	948,3 ko	2 621,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.5.63+dfsg-1	924,8 ko	2 016,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.5.63+dfsg-1+b2	710,9 ko	3 110,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.5.63+dfsg-1	929,4 ko	2 315,0 ko	[liste des fichiers]