Package: python-biopython (1.65+dfsg-1) [debports]

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libreria Python per bioinformatica (implementata in Python 2)

Il progetto Biopython è un'associazione internazionale di sviluppatori di strumenti Python disponibili liberamente per i calcoli biologici molecolari.

È uno sforzo collaborativo distribuito per sviluppare librerie e applicazioni Python che si rivolgono verso i bisogni dei lavori in bioinformatica attuali e futuri. Il codice sorgente è reso disponibile sotto la licenza Biopython, che è estremamente liberale e compatibile con pressoché qualsiasi licenza esistente. Il progetto lavora accanto alla Open Bioinformatics Foundation, che generosamente fornisce lo spazio web e CVS per il progetto.

Questo pacchetto è per la versione 2 di Python.

Other Packages Related to python-biopython

• dep: libc6 (>= 2.3.4)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: python (<< 2.8)

  Package not available

  dep: python (>= 2.7)

• dep: python-numpy (>= 1:1.8.0)

  Package not available

• dep: python-numpy-abi9

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• dep: python-reportlab

  Package not available

• rec: ncbi-blast+

  suite di prossima generazione degli strumenti di ricerca di sequenze BLAST

• rec: python-biopython-doc (= 1.65+dfsg-1)

  documentazione per la libreria Biopython

• sug: clustalo

  programma generico di allineamento di sequenze multiple per proteine

• sug: clustalw

  allineamento globale per sequenze multiple di nucleotidi o peptidi

• sug: dialign

  allineamenti multipli di sequenze basati su segmenti

• sug: dssp

  assegnazione della struttura secondaria di una proteina in base alla struttura 3D

• sug: emboss

  suite software open source europea per la biologia molecolare

• sug: fasttree

  alberi filogenetici da allineamenti di sequenze di proteine o nucleotidi

• sug: mafft

  programma per allineamenti multipli per sequenze aminoacidiche o nucleotidiche

• sug: muscle

  programma per allineamenti multipli di sequenze proteiche

• sug: phyml

  stime filogenetiche usando il metodo della massima verosimiglianza

• sug: prank

  kit per allineamenti probabilistici di sequenze di DNA, codoni e amminoacidi

• sug: probcons

  allineamenti multipli di sequenze probabilistici basati sulla coerenza

• sug: python-matplotlib

  Package not available

• sug: python-mysqldb

  Package not available

• sug: python-pil

  Package not available

• sug: python-psycopg2

  Package not available

• sug: python-rdflib (>= 4)

  Package not available

• sug: python-renderpm

  Package not available

• sug: python-tk

  Package not available

• sug: raxml

  RAxML (Randomized Axelerated Maximum Likelihood) di alberi filogenetici

• sug: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

• sug: t-coffee

  allineamento di sequenze multiple

• sug: wise (>= 2.4.1-16)

  confronto tra biopolimeri, come DNA e sequenze proteiche

Download python-biopython

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
hppa (unofficial port)	1,151.5 kB	7,815.0 kB	[list of files]