Package: python-biopython (1.65+dfsg-1) [debports]

[ Source:  ]

Pythonbibliotek for bioinformatikere - implementeret i Python 2

Biopythonprojektet er et internationalt forbund for udviklere af frit tilgængelige Pythonværktøjer til molekylær biologi via computeren.

Det er en distribueret fælles indsats for at udvikle Pythonbiblioteker og programmer som adresserer behovet for aktuelle og fremtidig arbejde i bioinformatik. Kildekoden gøres tilgængelig under Biopythonlicensen, som er meget liberal og kompatibel med næsten alle licenser i verden. Projektet arbejder sammen med Open Bioinformatics Foundation, som generøst tilbyder internet- og CVS-plads for projektet.

Denne pakke er rettet mod Python version 2.

Other Packages Related to python-biopython

• dep: libc6 (>= 2.3.4)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: python (<< 2.8)

  Package not available

  dep: python (>= 2.7)

• dep: python-numpy (>= 1:1.8.0)

  Package not available

• dep: python-numpy-abi9

  Package not available

• dep: python-reportlab

  Package not available

• rec: ncbi-blast+

  Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer

• rec: python-biopython-doc (= 1.65+dfsg-1)

  Dokumentation for biblioteket Biopython

• sug: clustalo

  Alment sekvenssammenligningsprogram for proteiner

• sug: clustalw

  Global nukleotid eller peptid sekvensjustering

• sug: dialign

  Segmentbaseret flersekvensjustering

• sug: dssp

  Sekundære proteinstruktur-opgave baseret på 3D-struktur

• sug: emboss

  Programpakke til europæisk molekylærbiologi

• sug: fasttree

  Fylogenetiske træer fra opstillinger af nukleotid- eller proteinsekvenser

• sug: mafft

  Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser

• sug: muscle

  Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser

• sug: phyml

  Fylogenisk estimering der bruger maksimum lIkelihood

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  Flersekvens-sammenstilling baseret på probabilistisk konsistens (PROBabilistic CONSistency)

• sug: python-matplotlib

  Package not available

• sug: python-mysqldb

  Package not available

• sug: python-pil

  Package not available

• sug: python-psycopg2

  Package not available

• sug: python-rdflib (>= 4)

  Package not available

• sug: python-renderpm

  Package not available

• sug: python-tk

  Package not available

• sug: raxml

  Randomized Axelerated Maximum Likelihood for pylogenetiske træer

• sug: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• sug: t-coffee

  Flersekvensjustering

• sug: wise (>= 2.4.1-16)

  Sammenligning af bioplymerer, såsom DNA- og protein-sekvenser

Download python-biopython

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
hppa (unofficial port)	1,151.5 kB	7,815.0 kB	[list of files]