Package: tabix (1.21+ds-0+exp2)
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Maintainers:
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- Andreas Tille (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
- Steffen Moeller (QA Page)
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External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Experimental package
Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.
indicizzatore generico per file di posizioni del genoma delimitate da TAB
Tabix indicizza i file in cui alcune colonne indicano coordinate di sequenze: nome (solitamente un cromosoma), inizio e fine. Il file di dati di input deve essere ordinato in base alla posizione e compresso con bgzip (fornito in questo pacchetto), che ha un'interfaccia simile a gzip. Dopo l'indicizzazione, tabix è in grado di recuperare velocemente righe di dati in base alle coordinate cromosomiche. Il veloce recupero dei dati funziona anche via rete se viene fornito un URI come nome di file.
Questo pacchetto è compilato dai sorgenti di HTSlib e fornisce gli strumenti bgzip, htsfile e tabix.
Other Packages Related to tabix
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- dep: libbz2-1.0
- libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime
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- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, sh4]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
-
- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- compressione e decompressione veloci di buffer interi basate su DEFLATE
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- dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)
- Custom compression for CRAM and others
-
- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- libreria per compressione in formato XZ
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
Download tabix
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 487.7 kB | 2,703.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 483.6 kB | 2,328.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 449.0 kB | 2,316.0 kB | [list of files] |
| armel | 411.2 kB | 2,089.0 kB | [list of files] |
| armhf | 414.3 kB | 1,517.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 466.6 kB | 2,305.0 kB | [list of files] |
| i386 | 528.3 kB | 2,629.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 432.5 kB | 2,081.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 440.5 kB | 2,685.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 499.5 kB | 3,148.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 517.1 kB | 3,084.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 497.4 kB | 1,920.0 kB | [list of files] |
| s390x | 472.1 kB | 2,504.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 500.4 kB | 2,060.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 406.8 kB | 3,163.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 485.2 kB | 2,281.0 kB | [list of files] |