Package: r-bioc-genomeinfodb (1.42.1+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-genomeinfodb  ]

Experimental package

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi

Questo pacchetto contiene le utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi ed altri "seqname".

Il pacchetto Seqnames contiene dati e funzioni che definiscono e permettono la traduzione tra diverse convenzioni per nominare sequenze di cromosomi (es. "chr1" rispetto a "1"), inclusa una funzione che tenta di piazzare i nomi di sequenza nel loro ordine naturale, invece che lessicografico.

Other Packages Related to r-bioc-genomeinfodb

• dep: r-api-4.0

  Package not available

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)

  funzioni generiche per Bioconductor

• dep: r-bioc-genomeinfodbdata

  tabelle di ricerca di BioConductor per ID tassonomici e specie

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)

  contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.25.12)

  implementazione di vettori e liste per BioConductor S4

• dep: r-bioc-ucsc.utils

  Low-level utilities to retrieve data from the UCSC Genome Browser

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-bsgenome

  infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings

• sug: r-bioc-genomicalignments

  rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle

• sug: r-bioc-genomicranges

  rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor

• sug: r-bioc-rsamtools

  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• sug: r-cran-data.table

  estensione GNU R di data.frame

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-r.utils

  varie utilità di programmazione GNU R

• sug: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

Download r-bioc-genomeinfodb

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	3,753.8 kB	5,034.0 kB	[list of files]