Package: r-bioc-annotationhub (3.14.0+dfsg-1)

[ Source: r-bioc-annotationhub  ]

Experimental package

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client GNU R per accedere a risorse AnnotationHug

Questo pacchetto fornisce un client per la risorsa web AnnotationHub per Bioconductor. La risorsa web AnnotationHub fornisce una posizione centralizzata in cui possono essere trovati file genomici (es. VCF, bed, wig) e altre risorse da posizioni standard (es. UCSC, Ensembl). Le risorse includono metadati su ciascuna risorsa, es. una descrizione testuale, etichette e data di modifica. Il client crea e gestisce una cache locale di file recuperati dall'utente, favorendo un accesso veloce e riproducibile.

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  Package not available

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  grammatica GNU R di manipolazione dei dati

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• dep: r-cran-rappdirs

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  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-biostrings

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• sug: r-bioc-experimenthub

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• sug: r-bioc-genomeinfodb

  utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi

• sug: r-bioc-genomicranges

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• sug: r-bioc-iranges

  contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R

• sug: r-bioc-rsamtools

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• sug: r-bioc-rtracklayer

  interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

• sug: r-bioc-summarizedexperiment

  contenitore per saggi BioConductor

• sug: r-bioc-txdbmaker

  Tools for making TxDb objects from genomic annotations

• sug: r-bioc-variantannotation

  annotazione di varianti genetiche per BioConductor

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

Download r-bioc-annotationhub

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	436.0 kB	726.0 kB	[list of files]