Package: seaview (1:4.7-1)
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Similar packages:
interfaccia multipiattaforma per l'allineamento di sequenze e filogenia
SeaView legge e scrive vari formati di file (NEXUS, MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE, Newick) di sequenze di DNA e proteiche e di alberi filogenetici. Gli allineamenti possono essere modificati a mano. È il motore dei programmi Muscle o Clustal Omega per l'allineamento multiplo di sequenze e permette anche di utilizzare qualsiasi algoritmo esterno di allineamento in grado di leggere e scrivere file in formato FASTA. Calcola gli alberi filogenetici in base alla parsimonia usando l'algoritmo dnapars/protpars di PHYLIP, in base alla distanza su una varietà di distanze evolutive con l'algoritmo NJ o BioNJ oppure in base alla massima verosimiglianza usando il programma PhyML 3.0. SeaView disegna alberi filogenetici sullo schermo o in file PostScript e permette di scaricare sequenze da EMBL/GenBank/UniProt usando Internet.
Other Packages Related to seaview
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]
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- dep: libfltk-images1.3
- Fast Light Toolkit - gestione caricamento delle immagini
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- dep: libfltk1.3 (>= 1.3.4)
- Fast Light Toolkit - libreria condivisa principale
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [not armhf]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
Download seaview
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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amd64 | 340.5 kB | 849.0 kB | [list of files] |
arm64 | 313.1 kB | 821.0 kB | [list of files] |
armhf | 289.8 kB | 579.0 kB | [list of files] |
i386 | 357.7 kB | 899.0 kB | [list of files] |