Package: r-bioc-rtracklayer (1.42.1-2)

[ Source: r-bioc-rtracklayer  ]

interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

Infrastruttura estensibile per interagire con più navigatori di genomi (attualmente incorporato UCSC) e manipolare tracce di annotazioni in vari formati (attualmente incorporati GFF, BED, bedGraph, BED15, WIG, BigWig e 2bit). L'utente può esportare e importare tracce verso e dai navigatori gestiti, così come interrogare e modificare lo stato del navigatore, come l'attuale porzione visualizzata.

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  Libreria C GNU: librerie condivise
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• dep: r-base-core (>= 3.5.2-1)

  nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1)

  funzioni generiche per Bioconductor

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  oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche

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  utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6)

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• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)

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• dep: r-bioc-zlibbioc

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• dep: r-cran-rcurl (>= 1.4-2)

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  pacchetto GNU R per l'analisi e la generazione di XML

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

• sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.33.4)

  infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings

• sug: r-bioc-genefilter

  metodi per filtrare geni da esperimenti con microarray

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle

• sug: r-bioc-limma

  modelli lineari per dati di microarray

• sug: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2,382.5 kB	3,818.0 kB	[list of files]
arm64	2,374.3 kB	3,818.0 kB	[list of files]
armhf	2,358.5 kB	3,659.0 kB	[list of files]
i386	2,401.8 kB	3,857.0 kB	[list of files]