Package: eigensoft (7.2.1+dfsg-1)

[ Source: eigensoft  ]

riduzione del bias della popolazione per analisi genetiche

Il pacchetto EIGENSOFT combina funzionalità dai metodi della genetica di popolazione di gruppo (Patterson et al. 2006) e il loro metodo di stratificazione EIGENSTRAT (Price et al. 2006). Il metodo EIGENSTRAT usa l'analisi delle componenti principali per modellare esplicitamente le differenze nell'ascendenza tra casi e controlli lungo assi continui di variazione; la correzione risultante è specifica della variazione in frequenza di un marker candidato nelle popolazioni ancestrali, minimizzando associazioni spurie mentre massimizza il potere di rilevare vere associazioni. Il pacchetto EIGENSOFT incorpora uno script di disegno e gestisce formati multipli di file e fenotipi quantitativi.

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