Package: cd-hit (4.6.8-2)

[ Source: cd-hit  ]

suite di programmi progettati per raggruppare velocemente sequenze

cd-hit contiene svariati programmi progettati per raggruppare velocemente sequenze. cd-hit raggruppa in cluster le proteine che soddisfano una soglia di similarità definita dall'utente. cd-hit-est è simile a cd-hit, ma progettato per raggruppare sequenze di nucleotidi (senza introni). cd-hit-est-2d è simile a cd-hit-2d, ma progettato per confrontare due insiemi di dati di nucleotidi. In questo pacchetto sono contenuti anche diversi altri programmi correlati. Per maggiori informazioni vedere il manuale utente di cd-hit, anch'esso parte di questo pacchetto.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::comparing, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to cd-hit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: perl

  "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall

Download cd-hit

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	508.9 kB	1,377.0 kB	[list of files]
arm64	492.7 kB	1,280.0 kB	[list of files]
armhf	484.1 kB	1,083.0 kB	[list of files]
i386	508.3 kB	1,424.0 kB	[list of files]