Package: cd-hit (4.8.1-3)

[ Source: cd-hit  ]

suite di programmi progettati per raggruppare velocemente sequenze

cd-hit contiene svariati programmi progettati per raggruppare velocemente sequenze. cd-hit raggruppa in cluster le proteine che soddisfano una soglia di similarità definita dall'utente. cd-hit-est è simile a cd-hit, ma progettato per raggruppare sequenze di nucleotidi (senza introni). cd-hit-est-2d è simile a cd-hit-2d, ma progettato per confrontare due insiemi di dati di nucleotidi. In questo pacchetto sono contenuti anche diversi altri programmi correlati. Per maggiori informazioni vedere il manuale utente di cd-hit, anch'esso parte di questo pacchetto.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::comparing, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to cd-hit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.7) [not amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: perl

  "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

Download cd-hit

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	510.1 kB	1,411.0 kB	[list of files]
arm64	493.7 kB	1,309.0 kB	[list of files]
armel	492.1 kB	1,319.0 kB	[list of files]
armhf	487.5 kB	1,111.0 kB	[list of files]
i386	510.9 kB	1,477.0 kB	[list of files]
mips64el	510.7 kB	1,588.0 kB	[list of files]
mipsel	511.1 kB	1,541.0 kB	[list of files]
ppc64el	508.6 kB	1,813.0 kB	[list of files]
s390x	496.5 kB	1,429.0 kB	[list of files]