Pacote: cd-hit (4.6.8-2)

[ Fonte: cd-hit  ]

suite of programs designed to quickly group sequences

cd-hit contains a number of programs designed to quickly group sequences. cd-hit groups proteins into clusters that meet a user-defined similarity threshold. cd-hit-est is similar to cd-hit, but designed to group nucleotide sequences (without introns). cd-hit-est-2d is similar to cd-hit-2d but designed to compare two nucleotide datasets. A number of other related programs are also in this package. Please see the cd-hit user manual, also part of this package, for further information.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Interface de usuário(a): Linha de comando, Função: role::program, use::comparing, Funciona com: Sequência biológica

Outros pacotes relacionados a cd-hit

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: perl

  Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall

Download de cd-hit

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	508.9 kB	1,377.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	492.7 kB	1,280.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	484.1 kB	1,083.0 kB	[lista de arquivos]
i386	508.3 kB	1,424.0 kB	[lista de arquivos]