Package: python3-pairtools (0.3.0-2 and others)

[ Source: pairtools  ]

infrastruttura per elaborare dati di sequenziamento da un esperimento Hi-C

Semplice e veloce infrastruttura a riga di comando per elaborare dati di sequenziamento da un esperimento Hi-C.

Elabora allineamenti di sequenze a terminali appaiati ed effettua le seguenti operazioni:

 - rileva giunzioni di legatura (alias coppie Hi-C) in sequenze allineate,
   a terminali accoppiati, di molecole di DNA Hi-C;
 - ordina file .pairs per analisi successive;
 - rileva, applica tag e rimuove duplicati di PCR/ottici;
 - genera statistiche esaurienti su insiemi di dati Hi-C;
 - seleziona coppie Hi-C in base a criteri definiti in modo flessibile;
 - ripristina allineamenti .sam da coppie Hi-C.

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Download python3-pairtools

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.3.0-2+b2	121.3 kB	440.0 kB	[list of files]
arm64	0.3.0-2+b2	110.5 kB	407.0 kB	[list of files]
armel	0.3.0-2+b2	109.3 kB	394.0 kB	[list of files]
armhf	0.3.0-2+b2	109.4 kB	342.0 kB	[list of files]
i386	0.3.0-2+b2	119.7 kB	426.0 kB	[list of files]
mips64el	0.3.0-2+b2	108.1 kB	437.0 kB	[list of files]
mipsel	0.3.0-2+b2	108.0 kB	414.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.3.0-2+b2	120.3 kB	479.0 kB	[list of files]
s390x	0.3.0-2+b2	107.5 kB	415.0 kB	[list of files]