Package: r-bioc-biovizbase (1.38.0-1)

[ Source: r-bioc-biovizbase  ]

utilità grafiche di base per GNU R per la visualizzazione di dati genomici

Il pacchetto biovizBase è progettato per fornire un insieme di utilità, schemi di colori e convenzioni per dati genomici. Serve come base per vari pacchetti di alto livello per la visualizzazione di dati biologici. Ciò fa risparmiare energie nello sviluppo e promuove la coerenza.

Other Packages Related to r-bioc-biovizbase

• dep: libc6 (>= 2.17)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.12

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

  nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R

• dep: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface per BioConductor

• dep: r-bioc-annotationfilter (>= 0.99.8)

  funzionalità per filtrare risorse di annotazioni per Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics

  funzioni generiche per Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.33.11)

  oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche

• dep: r-bioc-ensembldb (>= 1.99.13)

  utilità per GNU R per creare e usare un database di annotazioni basato su Ensembl

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.5.14)

  utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.1.16)

  rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor

• dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.21.19)

  strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.23.21)

  rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor

• dep: r-bioc-iranges (>= 1.99.28)

  contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.17.28)

  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.19)

  implementazione di vettori e liste per BioConductor S4

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  contenitore per saggi BioConductor

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.11.4)

  annotazione di varianti genetiche per BioConductor

• dep: r-cran-dichromat

  schemi di colore per dicromati per GNU R

• dep: r-cran-hmisc

  funzioni miste di Frank Harrell per GNU R

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  pacchetto GNU R che fornisce tavolozze adeguate di colori

• dep: r-cran-rlang

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• dep: r-cran-scales

  funzioni di scalatura per la visualizzazione

• rec: r-cran-foreign

  pacchetto GNU R per leggere/scrivere dati da altri sistemi statistici

• rec: r-cran-nnet

  pacchetto GNU R per reti neurali feed-forward

• rec: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

• sug: r-bioc-bsgenome

  infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings

• sug: r-bioc-rtracklayer

  interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

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