Package: r-bioc-bsgenome (1.58.0-1)

Links for r-bioc-bsgenome

Questo modulo BioConductor fornisce una qualche infrastruttura di base per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings.

dep: r-api-4.0

virtual package provided by r-base-core
dep: r-api-bioc-3.12

virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.8)

funzioni generiche per Bioconductor
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.25.6)

utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.10)

rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor
dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.16)

contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R
dep: r-bioc-rsamtools

allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R
dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.39.7)

interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.28)

implementazione di vettori e liste per BioConductor S4
dep: r-bioc-xvector (>= 0.29.3)

rappresentazione e manipolazione di sequenze esterne per BioConductor
dep: r-cran-matrixstats

metodi GNU R che si applicano a righe e colonne di una matrice

rec: r-bioc-biovizbase (>= 1.14.0)

utilità grafiche di base per GNU R per la visualizzazione di dati genomici

sug: r-bioc-biobase

funzioni base per Bioconductor
sug: r-cran-biocmanager

accesso al repository dei pacchetti del progetto Bioconductor
sug: r-cran-runit

pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

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