Paquet : r-bioc-biovizbase (1.54.0-2 et autres)

[ Paquet source : r-bioc-biovizbase  ]

GNU R basic graphic utilities for visualization of genomic data

The biovizBase package is designed to provide a set of utilities, color schemes and conventions for genomic data. It serves as the base for various high-level packages for biological data visualization. This saves development effort and encourages consistency.

Autres paquets associés à r-bioc-biovizbase

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa, mips64el, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.3) [ppc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: r-api-3 [sparc64]

  Paquet indisponible

• dep: r-api-4.0 [non sparc64]

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

  Paquet indisponible

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

  Paquet indisponible

• dep: r-api-bioc-3.20 [non hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 3.3.2-1) [sparc64]

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

  dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]

• dep: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface pour BioConductor

• dep: r-bioc-annotationfilter (>= 0.99.8) [non sparc64]

  fonctions pour le filtrage des ressources d'annotation de BioConductor

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.33.11)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-ensembldb (>= 1.3.8) [sparc64]

  GNU R utilities to create and use an Ensembl based annotation database

  dep: r-bioc-ensembldb (>= 1.99.13) [non sparc64]

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.5.14)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.1.16)

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

• dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.21.19)

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.23.21)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 1.99.28)

  conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.17.28)

  importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.19) [non sparc64]

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

  dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.9.25) [sparc64]

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.11.4)

  BioConductor annotation of genetic variants

• dep: r-cran-dichromat

  schémas de couleurs de GNU R pour les dichromates

• dep: r-cran-hmisc

  fonctions diverses de GNU R créées par Franck Harell

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées

• dep: r-cran-rlang [non sparc64]

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• dep: r-cran-scales

  Scale functions for visualization

• sug: r-bioc-bsgenome

  infrastructure de BioConductor pour les paquets de données de génome basés sur Biostrings

• sug: r-bioc-rtracklayer

  GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks

• sug: r-cran-runit

  paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

Télécharger r-bioc-biovizbase

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.54.0-2	2 785,7 ko	3 284,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.54.0-2	2 785,6 ko	3 233,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.54.0-2	2 785,7 ko	3 285,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.50.0-1	2 600,4 ko	3 079,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.50.0-1	2 600,8 ko	3 081,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.54.0-2	2 785,8 ko	3 285,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.54.0-2	2 786,1 ko	3 285,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.54.0-2	2 786,0 ko	3 284,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.54.0-2	2 785,5 ko	3 225,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.54.0-2	2 785,5 ko	3 225,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.50.0-1	2 600,0 ko	3 139,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.22.0-2	2 478,3 ko	2 861,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.46.0-1	2 599,5 ko	3 087,0 ko	[liste des fichiers]