Paket: r-bioc-biovizbase (1.52.0-1 und andere)

[ Quellcode: r-bioc-biovizbase  ]

GNU R basic graphic utilities for visualization of genomic data

The biovizBase package is designed to provide a set of utilities, color schemes and conventions for genomic data. It serves as the base for various high-level packages for biological data visualization. This saves development effort and encourages consistency.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-biovizbase

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [hppa, mips64el, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.3) [ppc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: r-api-3 [sparc64]

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-4.0 [nicht sparc64]

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-bioc-3.19 [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 3.3.2-1) [sparc64]

  GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

  dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]

• dep: r-bioc-annotationdbi [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

  dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.66.0) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-bioc-annotationfilter (>= 0.99.8) [hppa, ia64, sh4, x32]

  facilities for filtering Bioconductor annotation resources

  dep: r-bioc-annotationfilter (>= 1.28.0) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-bioc-biocgenerics [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  generic functions for Bioconductor

  dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.33.11) [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  GNU R string objects representing biological sequences

  dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-bioc-ensembldb (>= 1.3.8) [sparc64]

  GNU R utilities to create and use an Ensembl based annotation database

  dep: r-bioc-ensembldb (>= 1.99.13) [hppa, ia64, sh4, x32]

  dep: r-bioc-ensembldb (>= 2.28.0) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

  dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.5.14) [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.1.16) [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

  dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.40.0) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.21.19) [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

  dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.56.0) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.23.21) [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

  dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-bioc-iranges (>= 1.99.28) [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

  dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.17.28) [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

  dep: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.19) [hppa, ia64, sh4, x32]

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

  dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.9.25) [sparc64]

• dep: r-bioc-summarizedexperiment [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  BioConductor assay container

  dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.34.0) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.11.4) [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  BioConductor annotation of genetic variants

  dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.50.0) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• dep: r-cran-dichromat

  GNU R color schemes for dichromats

• dep: r-cran-hmisc

  Verschiedene Funktionen für GNU R von Frank Harrell

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R package providing suitable color palettes

• dep: r-cran-rlang [nicht sparc64]

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• dep: r-cran-scales

  Skalierungsfunktionen zur Visualisierung

• sug: r-bioc-bsgenome [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages

  sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.72.0) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• sug: r-bioc-rtracklayer [hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

  GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks

  sug: r-bioc-rtracklayer (>= 1.64.0) [nicht hppa, ia64, sh4, sparc64, x32]

• sug: r-cran-runit

  GNU-R-Paket, das ein Programmiergerüst für Komponententests bereitstellt

r-bioc-biovizbase herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.52.0-1	2.591,4 kB	3.128,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.52.0-1	2.592,1 kB	3.077,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.52.0-1	2.592,1 kB	3.129,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.50.0-1	2.600,4 kB	3.079,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.50.0-1	2.600,8 kB	3.081,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.52.0-1	2.592,2 kB	3.129,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.52.0-1	2.592,2 kB	3.129,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.52.0-1	2.592,4 kB	3.128,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.52.0-1	2.591,9 kB	3.069,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.52.0-1	2.592,0 kB	3.069,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.50.0-1	2.600,0 kB	3.139,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.22.0-2	2.478,3 kB	2.861,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.46.0-1	2.599,5 kB	3.087,0 kB	[Liste der Dateien]