Paquet : python3-pyspoa (0.0.8-3 et autres)

[ Paquet source : python-pyspoa  ]

Python bindings to spoa

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

This package presents Python bindings for the spoa library

Autres paquets associés à python3-pyspoa

• dep: libc6 (>= 2.32)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5) [amd64]

  SIMD partial order alignment library

  dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [non amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: python3 (<< 3.12)

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-pybind11

  pybind11 helper module for Python 3

Télécharger python3-pyspoa

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	0.0.8-3+b2	49,9 ko	143,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.0.8-3+b2	45,1 ko	151,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.0.8-3+b2	42,9 ko	126,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.0.8-3+b2	42,8 ko	98,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.0.8-3+b2	54,1 ko	146,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.0.8-3+b2	48,1 ko	220,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	0.0.8-3+b2	47,6 ko	154,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.0.8-3+b2	53,2 ko	215,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.0.8-3+b2	47,0 ko	151,0 ko	[liste des fichiers]