Paquet : libhts3t64 (1.21+ds-0+exp2)

[ Paquet source : htslib  ]

Paquet « expérimental »

Avertissement : ce paquet appartient à la distribution expérimentale. Cela signifie qu'il peut être instable ou bogué et peut éventuellement causer des pertes de données. Assurez-vous de consulter le journal des modifications (changelog) et les autres documentations existantes avant de l'utiliser.

C library for high-throughput sequencing data formats

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

Autres paquets associés à libhts3t64

• dep: libbz2-1.0

  Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.18.0)

  bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  compression et décompression de tampon complet rapide basée sur DEFLATE

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  librairie de compression au format XZ

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)

  trousse à outils SSL - bibliothèques partagées

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger libhts3t64

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	446,5 ko	1 406,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	451,9 ko	1 120,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	415,8 ko	1 272,0 ko	[liste des fichiers]
armel	393,0 ko	987,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	397,3 ko	747,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	459,6 ko	1 192,0 ko	[liste des fichiers]
i386	494,1 ko	1 227,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	395,8 ko	979,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	404,7 ko	1 383,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	476,4 ko	1 591,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	488,9 ko	1 591,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	458,9 ko	932,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	451,6 ko	1 179,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	501,6 ko	1 142,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	391,8 ko	5 264,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	454,4 ko	1 079,0 ko	[liste des fichiers]