Alle Optionen
trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]
[ Quellcode: htslib  ]

Paket: libhts3t64 (1.21+ds-0+exp2)

Links für libhts3t64

Screenshot

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket htslib herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Ähnliche Pakete:

Experimentelles Paket

Warnung: Dieses Paket stammt aus der Experimental-Distribution. Dies bedeutet, dass es höchstwahrscheinlich instabil oder fehlerhaft ist und sogar Datenverlust verursachen kann. Bitte lesen Sie den Changelog und andere möglicherweise verfügbare Dokumentation, bevor Sie es benutzen.

C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

HTSlib ist eine Implementierung einer vereinheitlichten C-Bibliothek für den Zugriff auf gängige Dateiformate, wie SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM und VCF (Variant Call Format), die für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten verwendet werden, und ist die von samtools und bcftools verwendete Kernbibliothek. HTSlib hängt nur von zlib ab. Es ist bekannt, dass sie mit gcc, g++ und clang kompatibel ist.

HTSlib implementiert einen verallgemeinerten BAM-Index (binary SAM) mit der Dateierweiterung »csi« (coordinate-sorted index). Der HTSlib-Dateileser sucht zuerst nach dem neuen Index und dann nach dem alten, wenn der neue Index nicht vorhanden ist.

Andere Pakete mit Bezug zu libhts3t64

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • erweitert

libhts3t64 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
alpha (inoffizielle Portierung) 446,5 kB1.406,0 kB [Liste der Dateien]
amd64 451,9 kB1.120,0 kB [Liste der Dateien]
arm64 415,8 kB1.272,0 kB [Liste der Dateien]
armel 393,0 kB987,0 kB [Liste der Dateien]
armhf 397,3 kB747,0 kB [Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung) 459,6 kB1.192,0 kB [Liste der Dateien]
i386 494,1 kB1.227,0 kB [Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung) 395,8 kB979,0 kB [Liste der Dateien]
mips64el 404,7 kB1.383,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung) 476,4 kB1.591,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 488,9 kB1.591,0 kB [Liste der Dateien]
riscv64 458,9 kB932,0 kB [Liste der Dateien]
s390x 451,6 kB1.179,0 kB [Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung) 501,6 kB1.142,0 kB [Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung) 391,8 kB5.264,0 kB [Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung) 454,4 kB1.079,0 kB [Liste der Dateien]