Paquet : proteinortho (5.16.b+dfsg-1)

[ Paquet source : proteinortho  ]

Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis

Proteinortho is a stand-alone tool that is geared towards large datasets and makes use of distributed computing techniques when run on multi-core hardware. It implements an extended version of the reciprocal best alignment heuristic. Proteinortho was applied to compute orthologous proteins in the complete set of all 717 eubacterial genomes available at NCBI at the beginning of 2009. Authors succeeded identifying thirty proteins present in 99% of all bacterial proteomes.

Autres paquets associés à proteinortho

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [non armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: ncbi-blast+

  suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération

• dep: python

  langage interactif de haut niveau orienté objet (version Python2)

Télécharger proteinortho

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	139,9 ko	292,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	137,0 ko	276,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	134,9 ko	255,0 ko	[liste des fichiers]
i386	141,2 ko	287,0 ko	[liste des fichiers]