Pakiet: proteinortho (5.16.b+dfsg-1)

[ Pakiet źródłowy: proteinortho  ]

Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis

Proteinortho is a stand-alone tool that is geared towards large datasets and makes use of distributed computing techniques when run on multi-core hardware. It implements an extended version of the reciprocal best alignment heuristic. Proteinortho was applied to compute orthologous proteins in the complete set of all 717 eubacterial genomes available at NCBI at the beginning of 2009. Authors succeeded identifying thirty proteins present in 99% of all bacterial proteomes.

Inne pakiety związane z proteinortho

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nie armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: python

  Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)

Pobieranie proteinortho

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	139,9 KiB	292,0 KiB	[lista plików]
arm64	137,0 KiB	276,0 KiB	[lista plików]
armhf	134,9 KiB	255,0 KiB	[lista plików]
i386	141,2 KiB	287,0 KiB	[lista plików]