Paquet : pynast (1.2.2-4)
Liens pour pynast
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
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- Journal des modifications Debian
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- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source pynast :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Steffen Moeller (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
- Tim Booth (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
alignement de séquences courtes d'ADN
Ce paquet fournit une nouvelle implémentation de l'outil NAST (« Nearest Alignment Space Termination ») en Python. Il a été préparé pour les séquenceurs de nouvelle génération.
Étant donné un ensemble de séquences et un alignement gabarit, PyNAST alignera les séquences en entrée suivant l'alignement gabarit, et renverra l'alignement à séquences multiples qui contient le même nombre de positions (ou colonnes) que l'alignement gabarit. Ceci facilite l'analyse de nouvelles séquences dans le contexte d'alignements existants, et de données additionnelles provenant d'alignements existants tels que les arbres phylogénétiques. Parce que n'importe quelles séquences de protéine ou d'acide nucléique peuvent être fournies, le paquet PyNAST n'est pas limité à l'analyse de séquences d'ADN ribosomique 16S.
Autres paquets associés à pynast
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- dep: libjs-jquery
- JavaScript library for dynamic web applications
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- dep: libjs-underscore
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- langage interactif de haut niveau orienté objet (version Python2)
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- rec: clustalw
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- Programme d'alignements multiples de séquences de protéine
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- liaisons pour la norme MPI (Message Passing Interface)
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- sug: uclust
- Paquet indisponible
Télécharger pynast
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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all | 79,7 ko | 302,0 ko | [liste des fichiers] |